Whale Wars keert terug met een nieuwe serie afleveringen. Gevaarlijker en controversiëler dan ooit. Whale Wars toont het spannende werk van de Sea Shepherd Conservation Society, een non-profit organisatie die zich inzet voor het behoud van het leven in de zee. In Whale Wars strijden zij tegen de illegale walvisvangst van Japanse walvisvaarders in het gebied rond Antarctica. Het is een strijd die beslist niet zonder gevaar is. De Japanners doen er alles aan om hun vangst door te zetten. Maar ook de Sea Shepherds deinzen niet terug voor een pittige confrontatie.